Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf4E9QAP7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4E9QAP7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf4E9QAP7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf4E9QAP7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms