Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp31E9Q6Y8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp31E9Q6Y8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp31E9Q6Y8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp31E9Q6Y8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp31E9Q6Y8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp31E9Q6Y8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp31E9Q6Y8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp31E9Q6Y8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp31E9Q6Y8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp31E9Q6Y8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp31E9Q6Y8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp31E9Q6Y8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp31E9Q6Y8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp31E9Q6Y8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp31E9Q6Y8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp31E9Q6Y8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp31E9Q6Y8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms