Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
BC005561E9Q5E2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
BC005561E9Q5E2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
BC005561E9Q5E2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
BC005561E9Q5E2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
BC005561E9Q5E2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
BC005561E9Q5E2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
BC005561E9Q5E2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
BC005561E9Q5E2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
BC005561E9Q5E2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
BC005561E9Q5E2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
BC005561E9Q5E2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
BC005561E9Q5E2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
BC005561E9Q5E2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
BC005561E9Q5E2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
BC005561E9Q5E2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
BC005561E9Q5E2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BC005561E9Q5E2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BC005561E9Q5E2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BC005561E9Q5E2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BC005561E9Q5E2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
BC005561E9Q5E2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
BC005561E9Q5E2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
BC005561E9Q5E2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
BC005561E9Q5E2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
BC005561E9Q5E2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
BC005561E9Q5E2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms