Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20518E9Q548 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm20518E9Q548 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm20518E9Q548 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20518E9Q548 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms