Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm9972E9Q053 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm9972E9Q053 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm9972E9Q053 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm9972E9Q053 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms