Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Ddx60E9PZQ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ddx60E9PZQ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ddx60E9PZQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ddx60E9PZQ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ddx60E9PZQ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ddx60E9PZQ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ddx60E9PZQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ddx60E9PZQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ddx60E9PZQ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ddx60E9PZQ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ddx60E9PZQ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ddx60E9PZQ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
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