Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
4931408C20RikE9PWP9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
4931408C20RikE9PWP9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
4931408C20RikE9PWP9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
4931408C20RikE9PWP9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
4931408C20RikE9PWP9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4931408C20RikE9PWP9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
4931408C20RikE9PWP9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
4931408C20RikE9PWP9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4931408C20RikE9PWP9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
4931408C20RikE9PWP9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4931408C20RikE9PWP9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
4931408C20RikE9PWP9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4931408C20RikE9PWP9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms