Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc144bE9PVZ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc144bE9PVZ3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc144bE9PVZ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms