Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc62E9PVD1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc62E9PVD1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc62E9PVD1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc62E9PVD1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc62E9PVD1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc62E9PVD1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc62E9PVD1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc62E9PVD1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc62E9PVD1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc62E9PVD1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc62E9PVD1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc62E9PVD1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc62E9PVD1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms