Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim5E9PV98 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim5E9PV98 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim5E9PV98 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim5E9PV98 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim5E9PV98 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim5E9PV98 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim5E9PV98 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim5E9PV98 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim5E9PV98 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim5E9PV98 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim5E9PV98 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim5E9PV98 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim5E9PV98 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim5E9PV98 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms