Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FgaE9PV24 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FgaE9PV24 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FgaE9PV24 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FgaE9PV24 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 361.5 ms