Protein–RNA interactions for Protein: E9PUW8

Ccdc24, Coiled-coil domain-containing 24, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc24E9PUW8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc24E9PUW8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc24E9PUW8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc24E9PUW8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc24E9PUW8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc24E9PUW8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc24E9PUW8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc24E9PUW8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc24E9PUW8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc24E9PUW8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc24E9PUW8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc24E9PUW8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc24E9PUW8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc24E9PUW8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc24E9PUW8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc24E9PUW8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms