Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp944E9PUS4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp944E9PUS4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp944E9PUS4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp944E9PUS4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp944E9PUS4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp944E9PUS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp944E9PUS4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zfp944E9PUS4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zfp944E9PUS4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms