Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Piezo1E2JF22 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Piezo1E2JF22 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Piezo1E2JF22 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Piezo1E2JF22 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Piezo1E2JF22 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Piezo1E2JF22 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Piezo1E2JF22 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Piezo1E2JF22 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Piezo1E2JF22 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Piezo1E2JF22 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Piezo1E2JF22 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Piezo1E2JF22 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Piezo1E2JF22 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Piezo1E2JF22 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Piezo1E2JF22 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Piezo1E2JF22 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Piezo1E2JF22 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Piezo1E2JF22 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Piezo1E2JF22 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Piezo1E2JF22 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Piezo1E2JF22 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Piezo1E2JF22 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Piezo1E2JF22 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Piezo1E2JF22 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Piezo1E2JF22 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms