Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc13D3YV10 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc13D3YV10 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc13D3YV10 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc13D3YV10 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc13D3YV10 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms