Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfx8D3YU81 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfx8D3YU81 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rfx8D3YU81 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfx8D3YU81 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rfx8D3YU81 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms