Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptprz1B9EKR1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptprz1B9EKR1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptprz1B9EKR1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptprz1B9EKR1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms