Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clrn2B2RVW2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Clrn2B2RVW2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clrn2B2RVW2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Clrn2B2RVW2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clrn2B2RVW2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Clrn2B2RVW2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Clrn2B2RVW2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clrn2B2RVW2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clrn2B2RVW2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clrn2B2RVW2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clrn2B2RVW2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms