Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a28B2RT89 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc22a28B2RT89 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc22a28B2RT89 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc22a28B2RT89 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc22a28B2RT89 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms