Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BC035947B2RQY6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BC035947B2RQY6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BC035947B2RQY6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms