Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp42B2RQC2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp42B2RQC2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp42B2RQC2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp42B2RQC2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp42B2RQC2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp42B2RQC2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp42B2RQC2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp42B2RQC2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp42B2RQC2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp42B2RQC2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp42B2RQC2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp42B2RQC2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp42B2RQC2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp42B2RQC2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp42B2RQC2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms