Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfrsf25B1AWN9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfrsf25B1AWN9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms