Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prr29B1ARI9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prr29B1ARI9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prr29B1ARI9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prr29B1ARI9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prr29B1ARI9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prr29B1ARI9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms