Protein–RNA interactions for Protein: A9YVJ5

Gbp11, Guanylate binding protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp11A9YVJ5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp11A9YVJ5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp11A9YVJ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp11A9YVJ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp11A9YVJ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms