Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
4930435E12RikA6X8Z9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
4930435E12RikA6X8Z9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms