Protein–RNA interactions for Protein: A2BI93

Ssxb9, Synovial sarcoma, X member B9, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb9A2BI93 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssxb9A2BI93 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ssxb9A2BI93 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ssxb9A2BI93 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ssxb9A2BI93 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssxb9A2BI93 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms