Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samt1A2BED8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samt1A2BED8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Samt1A2BED8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms