Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CtcflA2APF3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtcflA2APF3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtcflA2APF3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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