Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FocadA2AKG8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
FocadA2AKG8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
FocadA2AKG8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FocadA2AKG8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FocadA2AKG8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
FocadA2AKG8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FocadA2AKG8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FocadA2AKG8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
FocadA2AKG8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FocadA2AKG8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FocadA2AKG8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FocadA2AKG8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FocadA2AKG8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FocadA2AKG8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FocadA2AKG8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FocadA2AKG8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FocadA2AKG8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms