Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm13941A2AJ38 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm13941A2AJ38 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm13941A2AJ38 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm13941A2AJ38 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm13941A2AJ38 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms