Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm27029A2A4P4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm27029A2A4P4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm27029A2A4P4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm27029A2A4P4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm27029A2A4P4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm27029A2A4P4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm27029A2A4P4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm27029A2A4P4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm27029A2A4P4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms