Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2P6U8

4932415D10Rik, RIKEN cDNA 4932415D10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 4,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4932415D10RikA0A1W2P6U8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.5 ms