Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms