Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms