Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC034090A0A087WP46 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC034090A0A087WP46 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC034090A0A087WP46 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC034090A0A087WP46 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms