RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471023.1

NOP56-211, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-211ENST00000471023 LMX1AQ8TE12 382 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PATE1Q8WXA2 126 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ULK4Q96C45 1275 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SLC46A1Q96NT5 459 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 COPS8Q99627 209 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 FAM114A2Q9NRY5 505 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TAAR2Q9P1P5 351 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GALPQ9UBC7 116 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SPASTQ9UBP0 616 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GPR34Q9UPC5 381 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 WDR37Q9Y2I8 494 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PSAT1Q9Y617 370 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PTPRBP23467 1997 aa7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CPED1A4D0V7 1026 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 OR2AG2A6NM03 316 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 IQCF5A8MTL0 148 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 FFAR2O15552 330 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CSO75390 466 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 POP7O75817 140 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 PIAS1O75925 651 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 AP2A2O94973 939 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 MPOP05164 745 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 RHOXF2BP0C7M4 288 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ERVK-10P10266 1014 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ACP5P13686 325 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 OGNP20774 298 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TNFRSF8P28908 595 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SLC1A2P43004 574 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 MAGEA4P43358 317 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CSRP3P50461 194 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CXADRP78310 365 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GABREP78334 506 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 MPP1Q00013 466 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CFHR1Q03591 330 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CTBP1Q13363 440 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 LRP8Q14114 963 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 NR0B2Q15466 257 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TCEA2Q15560 299 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 LONRF1Q17RB8 773 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 METRNLQ641Q3 311 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 DET1Q7L5Y6 550 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GALNT7Q86SF2 657 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 LRRTM4Q86VH4 590 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CERS2Q96G23 380 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 C9orf72Q96LT7 481 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 RHOXF2Q9BQY4 288 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 NAT9Q9BTE0 207 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 KCNK6Q9Y257 313 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 MGAQ8IWI9 3026 aa7.28□□□□□ -1.24
NOP56-211ENST00000471023 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.27□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa7.27□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 HMX2A2RU54 273 aa7.27□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 MGAT4DA6NG13 374 aa7.27□□□□□ -1.25
NOP56-211ENST00000471023 FAM159BA6NKW6 160 aa7.27□□□□□ -1.25
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