RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 RHOJQ9H4E5 214 aa17.94■□□□□ 0.46
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PTX4-201ENST00000293922 INPP4BO15327 924 aa17.93■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 HAUS5O94927 633 aa17.93■□□□□ 0.46
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PTX4-201ENST00000293922 SPRP35270 261 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
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PTX4-201ENST00000293922 C19orf48Q6RUI8 117 aa17.93■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa17.93■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 HEXDCQ8WVB3 486 aa17.93■□□□□ 0.46
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PTX4-201ENST00000293922 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
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PTX4-201ENST00000293922 LRRN3Q9H3W5 708 aa17.9■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 SATB2Q9UPW6 733 aa17.9■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 PMS2P1A4D2B8 440 aa17.89■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 CFAP99D6REC4 459 aa17.89■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 DNAJC6O75061 913 aa17.89■□□□□ 0.46
PTX4-201ENST00000293922 ASMTLO95671 621 aa17.89■□□□□ 0.46
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