RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 ARL15Q9NXU5 204 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF221Q9UK13 617 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 HS3ST4Q9Y661 456 aa16.85■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 OR51F1A6NGY5 319 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 G3V2L1 256 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 VILLO15195 856 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 SLC7A4O43246 635 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 LRATO95237 230 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 STARD3Q14849 445 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 TSSK3Q96PN8 268 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 FCRL5Q96RD9 977 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 SLC28A3Q9HAS3 691 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 RIMS3Q9UJD0 308 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 TLR6Q9Y2C9 796 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 RAI2Q9Y5P3 530 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 COL4A5P29400 1685 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 FAM25AB3EWG3 89 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 FAM25CB3EWG5 89 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 FAM25GB3EWG6 89 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 J3KR12 359 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 CNTN5O94779 1100 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 PGLSO95336 258 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 IFNA14P01570 189 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 ELK4P28324 431 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 DOK6Q6PKX4 331 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 USP45Q70EL2 814 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 LRRTM3Q86VH5 581 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 SUSD6Q92537 303 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 SLC22A1O15245 554 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 ABCB7O75027 752 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 SLC35E2BP0CK96 405 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 CXCR3P49682 368 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 RELAQ04206 551 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 STK40Q8N2I9 435 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 PXYLP1Q8TE99 480 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 COX7A2P14406 83 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 ACVRL1P37023 503 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 RAB14P61106 215 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 CREMQ03060 361 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 BIRC7Q96CA5 298 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF778Q96MU6 729 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 PANX1Q96RD7 426 aa16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 FUOMA2VDF0 154 aa16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF487B1APH4 448 aa16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 CDH1P12830 882 aa16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 ACSM2AQ08AH3 577 aa16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 ACSM2BQ68CK6 577 aa16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 ERAP2Q6P179 960 aa16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 BORAQ6PGQ7 559 aa16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 HID1Q8IV36 788 aa16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 NMUR1Q9HB89 426 aa16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
TRPC1-201ENST00000273482 PSMD11O00231 422 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 GRID2O43424 1007 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 TMCC2O75069 709 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 CAPN1P07384 714 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 FMO3P31513 532 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 MC4RP32245 332 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 MEP1AQ16819 746 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM53Q6P2H8 277 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 SVOPLQ8N434 492 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 EXD2Q9NVH0 621 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 CARNS1A5YM72 827 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD33BA6NCL7 494 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 FAM163BP0C2L3 166 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 C14orf80Q86SX3 495 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 SLC22A16Q86VW1 577 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 TPK1Q9H3S4 243 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 DKK3Q9UBP4 350 aa16.83■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PP18 115 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 ARSFP54793 590 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 PMS2P3Q13401 168 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 SYT16Q17RD7 645 aa16.82■□□□□ 0.28
TRPC1-201ENST00000273482 RTP2Q5QGT7 225 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms