RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	XPR1	Q9UBH6	696 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	BPTF	Q12830	3046 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PIEZO1	Q92508	2521 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GMNC	A6NCL1	334 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	POM121B	A6NF01	834 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2AG2	A6NM03	316 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GRID2	O43424	1007 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	DLX3	O60479	287 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	FUCA1	P04066	466 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	C8G	P07360	202 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	MYL2	P10916	166 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ALDH3A1	P30838	453 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINB5	P36952	375 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GMPR	P36959	345 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	CDKL1	Q00532	357 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SP140	Q13342	867 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	NFATC4	Q14934	902 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PCLAF	Q15004	111 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	METRNL	Q641Q3	311 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ATG16L1	Q676U5	607 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	XKR5	Q6UX68	686 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	AMZ2	Q86W34	360 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	MGARP	Q8TDB4	240 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ELMO1	Q92556	727 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	NELL1	Q92832	810 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	KLK6	Q92876	244 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM159	Q96B96	161 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SPACA7	Q96KW9	195 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	EPN3	Q9H201	632 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	OR1A2	Q9Y585	309 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PRR23A	A6NEV1	266 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	STX16	O14662	325 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	NDUFS2	O75306	463 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	IMPDH1	P20839	514 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	HTR1B	P28222	390 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	NBL1	P41271	181 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GNGT1	P63211	74 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	CBX1	P83916	185 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PTK2B	Q14289	1009 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4D1	Q15615	310 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PYCR3	Q53H96	274 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SBSN	Q6UWP8	590 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	DET1	Q7L5Y6	550 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	RLN3	Q8WXF3	142 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SCYL1	Q96KG9	808 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR92	Q96MX6	357 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ALG9	Q9H6U8	611 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	COG4	Q9H9E3	785 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM202	A6NGA9	273 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM114	B3SHH9	223 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PROB1	E7EW31	1015 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TK2	O00142	265 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	CDC7	O00311	574 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	BTN3A1	O00481	513 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM24	O75264	130 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	FSBP	O95073	299 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	TGDS	O95455	350 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINE1	P05121	402 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	VCL	P18206	1134 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ITGB6	P18564	788 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	ACADL	P28330	430 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GGT5	P36269	586 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	GLRB	P48167	497 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	AP1S2	P56377	157 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TRAF4-208	ENST00000469529	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41

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