RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157		A0A1W2PP18	115 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	XYLB	O75191	536 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	GPR32	O75388	356 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	SOAT2	O75908	522 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	CCNK	O75909	580 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	MFN2	O95140	757 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	DNAJB1	P25685	340 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	AGTR2	P50052	363 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	OR4D2	P58180	307 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	METTL6	Q8TCB7	284 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	EXOC2	Q96KP1	924 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	B3GALT6	Q96L58	329 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	ASB2	Q96Q27	587 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	SARDH	Q9UL12	918 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSUH2-208	ENST00000455157	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CXCL11	O14625	94 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PTGES	O14684	152 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SHOX	O15266	292 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	C1R	P00736	705 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CST1	P01037	141 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	NTRK1	P04629	796 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CAPN1	P07384	714 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	HSD17B1	P14061	328 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GGT5	P36269	586 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PSMD8	P48556	350 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	DGKQ	P52824	942 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	DSTN	P60981	165 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	LCP2	Q13094	533 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PRKG2	Q13237	762 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MEP1A	Q16819	746 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	LACC1	Q8IV20	430 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SGCD	Q92629	289 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TEX37	Q96LM6	180 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC30A3	Q99726	388 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF221	Q9UK13	617 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CDH9	Q9ULB4	789 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	BRCA2	P51587	3418 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157		G3V2T6	193 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FZD9	O00144	591 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	IRAK2	O43187	625 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	OR4F21	O95013	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	S1PR4	O95977	384 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNE1	P15382	129 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CD40LG	P29965	261 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ARSF	P54793	590 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	GPLD1	P80108	840 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	LHPP	Q9H008	270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	COMMD8	Q9NX08	183 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	FXYD1	O00168	92 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CDC7	O00311	574 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC7A4	O43246	635 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	CD1D	P15813	335 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PRKACG	P22612	351 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PSMB9	P28065	219 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	OR3A3	P47888	321 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSUH2-208	ENST00000455157	PIK3CG	P48736	1102 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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