RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 CD1DP15813 335 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 SERPINB10P48595 397 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 C1QTNF8P60827 252 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 NAA20P61599 178 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 UNC50Q53HI1 259 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.36□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 ZIC5Q96T25 663 aa8.36□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 OSER1Q9NX31 292 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.36□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 CYP20A1Q6UW02 462 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 DDHD1Q8NEL9 900 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRK-206ENST00000368215 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 ADI1Q9BV57 179 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 REEP1Q9H902 201 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 GRM6O15303 877 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-206ENST00000368215 EPOP01588 193 aa8.34□□□□□ -1.07
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