RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
ZBED6-202ENST00000550078 ACTG1P63261 375 aa5.21□□□□□ -1.58
ZBED6-202ENST00000550078 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.21□□□□□ -1.58
ZBED6-202ENST00000550078 Q1RN00 199 aa5.21□□□□□ -1.58
ZBED6-202ENST00000550078 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.21□□□□□ -1.58
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF613Q6PF04 617 aa5.21□□□□□ -1.58
ZBED6-202ENST00000550078 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
ZBED6-202ENST00000550078 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.21□□□□□ -1.58
ZBED6-202ENST00000550078 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
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ZBED6-202ENST00000550078 LMBRD1Q9NUN5 540 aa5.21□□□□□ -1.58
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ZBED6-202ENST00000550078 PARD3Q8TEW0 1356 aa5.21□□□□□ -1.58
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ZBED6-202ENST00000550078 MED24O75448 989 aa5.21□□□□□ -1.58
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ZBED6-202ENST00000550078 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.21□□□□□ -1.58
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ZBED6-202ENST00000550078 ADGRL1O94910 1474 aa5.21□□□□□ -1.58
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ZBED6-202ENST00000550078 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.585e-8■■□□□ 11.6
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ZBED6-202ENST00000550078 FNDC5Q8NAU1 212 aa5.21□□□□□ -1.58
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ZBED6-202ENST00000550078 ZNF510Q9Y2H8 683 aa5.21□□□□□ -1.58
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ZBED6-202ENST00000550078 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.2□□□□□ -1.58
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