RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 IKZF3Q9UKT9 509 aa21.92■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.92■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 CD1DP15813 335 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 MMP12P39900 470 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 KCNC1P48547 511 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 ITIH4Q14624 930 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 NXPE1Q8N323 547 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 ANKS4BQ8N8V4 417 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 C10orf82Q8WW14 230 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 SPATA16Q9BXB7 569 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 CYP4F12Q9HCS2 524 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 PKD2L2Q9NZM6 624 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa21.91■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 ANKRD65E5RJM6 399 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 VPS26AO75436 327 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 TIE1P35590 1138 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 PFKPQ01813 784 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 KLC3Q6P597 504 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 CERS6Q6ZMG9 384 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 TMIEQ8NEW7 156 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 RDH11Q8TC12 318 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 C7orf26Q96N11 449 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 CLPBQ9H078 707 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 POPDC3Q9HBV1 291 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 E5RI56 91 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 TRIM13O60858 407 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 ITGB7P26010 798 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 ERAP2Q6P179 960 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 CHPFQ8IZ52 775 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 CD200R1Q8TD46 325 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 SORT1Q99523 831 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 THAP1Q9NVV9 213 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 KLHL14Q9P2G3 628 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 MID2Q9UJV3 735 aa21.9■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa21.89■■□□□ 1.1
VSX1-205ENST00000429762 A0A0G2JND7 137 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 K7EQS6 105 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 ESR1P03372 595 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 ZNF30P17039 623 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 ACAP2Q15057 778 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 OR4D1Q15615 310 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 ISCA2Q86U28 154 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 CPNE9Q8IYJ1 553 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 RBFAQ8N0V3 343 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 OR6Y1Q8NGX8 325 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 PPM1EQ8WY54 764 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 C19orf43Q9BQ61 176 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 PLXNA2O75051 1894 aa21.89■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 ELFN1P0C7U0 828 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 GM2AP17900 193 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 ACOX1Q15067 660 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 IER5LQ5T953 404 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 LIPMQ5VYY2 423 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 LIPIQ6XZB0 460 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 LIMD1Q9UGP4 676 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 LRRK1Q38SD2 2015 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 MTX2O75431 263 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 PYGLP06737 847 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 NAGLUP54802 743 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 B4GALNT1Q00973 533 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 GPR33Q49SQ1 333 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 CRLF3Q8IUI8 442 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 HCAR2Q8TDS4 363 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 FAM83DQ9H4H8 585 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 PNPOQ9NVS9 261 aa21.88■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.87■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa21.87■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.87■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 TRIM16O95361 564 aa21.87■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 ADRB3P13945 408 aa21.87■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 CTHP32929 405 aa21.87■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 LIG3P49916 1009 aa21.87■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 CLCN7P51798 805 aa21.87■■□□□ 1.09
VSX1-205ENST00000429762 PTPN5P54829 565 aa21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms