RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 SPEM1Q8N4L4 309 aa18.51■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 DEFB119Q8N690 84 aa18.51■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC8CQ8TDW0 803 aa18.51■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 PAFAH2Q99487 392 aa18.51■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 MYOCQ99972 504 aa18.51■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 K7ESM1 405 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 MSH2P43246 934 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ABCA7Q8IZY2 2146 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 CXorf40AQ8TE69 158 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 DCAKDQ8WVC6 231 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 FZD3Q9NPG1 666 aa18.5■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 FAM159BA6NKW6 160 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ATP5HO75947 161 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 GABRB3P28472 473 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 RPS9P46781 194 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ELP6Q0PNE2 266 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM52BQ4KMG9 183 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF470Q6ECI4 717 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 NEPROQ6NW34 567 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 LVRNQ6Q4G3 990 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 OR4L1Q8NH43 312 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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PRRT1-201ENST00000211413 ITM2CQ9NQX7 267 aa18.49■□□□□ 0.55
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PRRT1-201ENST00000211413 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 EML5Q05BV3 1969 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 TM9SF1O15321 606 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 UNC5CO95185 931 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 SLC1A2P43004 574 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 PLA2G15Q8NCC3 412 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ACVR1CQ8NER5 493 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 COQ10AQ96MF6 247 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 FBRSQ9HAH7 460 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ZFATQ9P243 1243 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa18.49■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 LAMA1P25391 3075 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 A0A1W2PQU0 124 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 K7ESF4 209 aa18.48■□□□□ 0.55
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PRRT1-201ENST00000211413 PRAMEF1O95521 474 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 CXCL12P48061 93 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 SETDB1Q15047 1291 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 PDPK2PQ6A1A2 396 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 NLRP9Q7RTR0 991 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 TAS2R42Q7RTR8 314 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 BANPQ8N9N5 519 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 CYTH2Q99418 400 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 TXLNGQ9NUQ3 528 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 CA5BQ9Y2D0 317 aa18.48■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 MYO15AQ9UKN7 3530 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 FADS2P1A8MWK0 482 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 MTX2O75431 263 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 SPAG6O75602 509 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 HAUS5O94927 633 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF30P17039 623 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 PAMP19021 973 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 AOC1P19801 751 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ALDH3A1P30838 453 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 SPAM1P38567 509 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 BMPR2Q13873 1038 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 SPDYAQ5MJ70 313 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 RAB7BQ96AH8 199 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 FAM131CQ96AQ9 280 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 SPATA16Q9BXB7 569 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 VPS11Q9H270 941 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ASB8Q9H765 288 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 PKD2L2Q9NZM6 624 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 FAM86C2PA6NEL3 165 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 WNT9AO14904 365 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 RAD51BO15315 384 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 SLC31A1O15431 190 aa18.47■□□□□ 0.55
PRRT1-201ENST00000211413 SLC7A4O43246 635 aa18.47■□□□□ 0.55
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