RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-205ENST00000391970 MMP25Q9NPA2 562 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRC-205ENST00000391970 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-205ENST00000391970 FBXW11Q9UKB1 542 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRC-205ENST00000391970 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-205ENST00000391970 SPRY4Q9C004 299 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRC-205ENST00000391970 HIST1H2ADP20671 130 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-205ENST00000391970 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-205ENST00000391970 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
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PTPRC-205ENST00000391970 TXNDC15Q96J42 360 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
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