RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592561.5

PSMD8-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 8, human

TSL 2

Gene PSMD8, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD8-208	ENST00000592561	INVS	Q9Y283	1065 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	EML5	Q05BV3	1969 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	C10orf142	B7Z368	130 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561		E7EVH7	732 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	NDUFS2	O75306	463 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	HLA-DPA1	P20036	260 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	BCKDHB	P21953	392 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	ADRA1A	P35348	466 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	MMP12	P39900	470 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	ITGA8	P53708	1063 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	SLC18A1	P54219	525 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	GPS1	Q13098	491 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	GALNT3	Q14435	633 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	MORF4L2	Q15014	288 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	SLC1A5	Q15758	541 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	QPCT	Q16769	361 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	PROX2	Q3B8N5	592 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	RANBP10	Q6VN20	620 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TDRP	Q86YL5	185 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	RMDN1	Q96DB5	314 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	LYSMD1	Q96S90	227 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	FICD	Q9BVA6	458 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	GPR174	Q9BXC1	333 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	FETUB	Q9UGM5	382 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	CAPN8	A6NHC0	703 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	NEMP1	O14524	444 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	CDH16	O75309	829 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	SUN1	O94901	812 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	PCDH8	O95206	1070 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	PRKCG	P05129	697 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	FGF1	P05230	155 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	APRT	P07741	180 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	ALPI	P09923	528 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	CTPS1	P17812	591 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	VIPR1	P32241	457 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	NBL1	P41271	181 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	MAGEA6	P43360	314 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	CHRNA4	P43681	627 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	VPS41	P49754	854 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	DPPA4	Q7L190	304 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	LINC00523	Q86TU6	105 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TRIM69	Q86WT6	500 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	HORMAD1	Q86X24	394 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	SENP1	Q9P0U3	644 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	GGT7	Q9UJ14	662 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PSMD8-208	ENST00000592561	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		10.97	□□□□□ -0.65

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