RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 RNF146Q9NTX7 359 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A088AWK7 358 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 A8MVJ9 347 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 M0R129 80 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 EYA4O95677 639 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 TIGD3Q6B0B8 471 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF709Q8N972 641 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 HASPINQ8TF76 798 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 CREB3L1Q96BA8 519 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 RHOBTB3O94955 611 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 SHBGP04278 402 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 GNG2P59768 71 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 PDIA5Q14554 519 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 IL27RAQ6UWB1 636 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 GCNT7Q6ZNI0 430 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 TMED9Q9BVK6 235 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF175Q9Y473 711 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 SEC22BO75396 215 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 SERPINB7O75635 380 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 HYIQ5T013 277 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 BPIFB1Q8TDL5 484 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 MARK4Q96L34 752 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 NELFAQ9H3P2 528 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A0G2JMP0 313 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 PRRG1O14668 218 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 SP140Q13342 867 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 MSANTD2Q6P1R3 559 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 OR4M2Q8NGB6 313 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 DNAJB14Q8TBM8 379 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 RIPK2O43353 540 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 TDGQ13569 410 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 STILQ15468 1287 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ALG10Q5BKT4 473 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC34A3Q8N130 599 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 VPS45Q9NRW7 570 aa11.18□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ACOT2P49753 483 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 S100A10P60903 97 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 FGL2Q14314 439 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 VPS26BQ4G0F5 336 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ADGRE3Q9BY15 652 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 MMP10P09238 476 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 KAT2BQ92831 832 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 UFD1Q92890 307 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 SLX4Q8IY92 1834 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1W2PQJ5 194 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 CCNB2O95067 398 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 CYP2C9P11712 490 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 MTHFRP42898 656 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ECT2LQ008S8 904 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 C11orf65Q8NCR3 313 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 TOP1MTQ969P6 601 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 CPNE1Q99829 537 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 IL25Q9H293 177 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ZMYM5Q9UJ78 669 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 AKAP12Q02952 1782 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 RPL35P42766 123 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 DCST2Q5T1A1 773 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM143Q96AN5 459 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 DRD4P21917 467 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 WEE1P30291 646 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 DEFA6Q01524 100 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM136AQ96C01 138 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 IRF1P10914 325 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 QPCTQ16769 361 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 PAQR7Q86WK9 346 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 FNDC11Q9BVV2 318 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 BIN3Q9NQY0 253 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A087X1B8 175 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 CPB1P15086 417 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 ACTR3P61158 418 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 SEC14L1Q92503 715 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 DISC1C4P0D8 188 aa11.17□□□□□ -0.62
HDGFL3-201ENST00000299633 TBX3O15119 743 aa11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms