RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429254.1

LNCPRESS1-201, Transcript of lncRNA p53 regulated and ESC associated 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LNCPRESS1, Length 756 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MTM1Q13496 603 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PTK2BQ14289 1009 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GALNT3Q14435 633 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 LRRC66Q68CR7 880 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MACC1Q6ZN28 852 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PELI3Q8N2H9 469 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SLC25A45Q8N413 288 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DTD2Q96FN9 168 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 IFT43Q96FT9 208 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CDC6Q99741 560 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 APOOQ9BUR5 198 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 UBP1Q9NZI7 540 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 FTSJ1Q9UET6 329 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 KLF15Q9UIH9 416 aa15.48■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 K7ESM1 405 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PSMD11O00231 422 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 FFAR2O15552 330 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MTSS1O43312 755 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NRDCO43847 1150 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TJP3O95049 919 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PTMAP06454 111 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 C1SP09871 688 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 JUNDP17535 347 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NFKB1P19838 968 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PMLP29590 882 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 XRCC4Q13426 336 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NFATC4Q14934 902 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 QPCTQ16769 361 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 Q6ZVL8 140 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GLRX5Q86SX6 157 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RBFAQ8N0V3 343 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ZNF567Q8N184 647 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PNPLA1Q8N8W4 532 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CD84Q9UIB8 345 aa15.47■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 H3BM21 787 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TNFSF14O43557 240 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PMPCBO75439 489 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CLDN7O95471 211 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RBP3P10745 1247 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PTSQ03393 145 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PNCKQ6P2M8 343 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ENPP7Q6UWV6 458 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PID1Q7Z2X4 250 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SLCO6A1Q86UG4 719 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PHACTR4Q8IZ21 702 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TADA1Q96BN2 335 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TRIB3Q96RU7 358 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ADGRE3Q9BY15 652 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
LNCPRESS1-201ENST00000429254 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TRIM38O00635 465 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ENC1O14682 589 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SCAMP1O15126 338 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PIRTP0C851 137 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GIMD1P0DJR0 217 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ZNF30P17039 623 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SPINK2P20155 84 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 HTR1BP28222 390 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PPARDQ03181 441 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CDK18Q07002 472 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DNAJC3Q13217 504 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 C1orf61Q13536 156 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TCEA2Q15560 299 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CCDC157Q569K6 752 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 FAXCQ5TGI0 409 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 KCTD16Q68DU8 428 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RAET1GQ6H3X3 334 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 LMX1AQ8TE12 382 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 LYSMD1Q96S90 227 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 VAT1Q99536 393 aa15.45■□□□□ 0.06
LNCPRESS1-201ENST00000429254 LGR4Q9BXB1 951 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.8 ms