RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-206ENST00000368215 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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PTPRK-206ENST00000368215 RNF217Q8TC41 542 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRK-206ENST00000368215 C19orf60Q96EN9 201 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRK-206ENST00000368215 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRK-206ENST00000368215 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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PTPRK-206ENST00000368215 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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PTPRK-206ENST00000368215 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
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PTPRK-206ENST00000368215 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRK-206ENST00000368215 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRK-206ENST00000368215 ALFQ53S48 1182 aa8.46□□□□□ -1.05
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PTPRK-206ENST00000368215 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-206ENST00000368215 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-206ENST00000368215 FBXO27Q8NI29 283 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-206ENST00000368215 FBXO30Q8TB52 745 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-206ENST00000368215 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-206ENST00000368215 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRK-206ENST00000368215 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
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