RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 CBFA2T3O75081 653 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 NFKB1P19838 968 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 CR2P20023 1033 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 CD38P28907 300 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 FDFT1P37268 417 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 ADCY8P40145 1251 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 RPL21P46778 160 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 GUCY2DQ02846 1103 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 ZNF423Q2M1K9 1284 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 MYRIPQ8NFW9 859 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 VOPP1Q96AW1 172 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 FCRL5Q96RD9 977 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 HEPHQ9BQS7 1158 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 HDAC8Q9BY41 377 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 TM6SF2Q9BZW4 377 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 SLC25A51Q9H1U9 297 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 PREBQ9HCU5 417 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 RAB6BQ9NRW1 208 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 RSPH14Q9UHP6 348 aa18.38■□□□□ 0.53
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PTX4-201ENST00000293922 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa18.38■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 FREM2Q5SZK8 3169 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 H0Y8X5 98 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 PSMB4P28070 264 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 C21orf59P57076 290 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 FOXC1Q12948 553 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 SEMA5AQ13591 1074 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 PLPP6Q8IY26 295 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 ARRDC2Q8TBH0 407 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 SNF8Q96H20 258 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 TRIM31Q9BZY9 425 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 ETNK1Q9HBU6 452 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 EPB41L5Q9HCM4 733 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 DYRK4Q9NR20 520 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 SNX24Q9Y343 169 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 TTLL3Q9Y4R7 772 aa18.37■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 ZZEF1O43149 2961 aa18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 CTIFO43310 598 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
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PTX4-201ENST00000293922 RGRP47804 291 aa18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 MAXP61244 160 aa18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 RHOAP61586 193 aa18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 CCDC15Q0P6D6 951 aa18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 TADA1Q96BN2 335 aa18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R16AQ96I34 528 aa18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 DPH5Q9H2P9 285 aa18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 GDF3Q9NR23 364 aa18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 GRHL1Q9NZI5 618 aa18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 WHRNQ9P202 907 aa18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 DMTF1Q9Y222 760 aa18.36■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 ESYT3A0FGR9 886 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 TP73O15350 636 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 ITIH2P19823 946 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 ITGB7P26010 798 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 GKP32189 559 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 CSNK1DP48730 415 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 CCT8P50990 548 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 BASP1P80723 227 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 DSC2Q02487 901 aa18.35■□□□□ 0.53
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PTX4-201ENST00000293922 SLC14A2Q15849 920 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 RALGPS1Q5JS13 557 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 FAXCQ5TGI0 409 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 NEK5Q6P3R8 708 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 PCGF5Q86SE9 256 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 IFT20Q8IY31 132 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 BBOF1Q8ND07 529 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 OR2AP1Q8NGE2 309 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 OR6K2Q8NGY2 324 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 CPT1BQ92523 772 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 SKA1Q96BD8 255 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 NUDCD1Q96RS6 583 aa18.35■□□□□ 0.53
PTX4-201ENST00000293922 SEMA3CQ99985 751 aa18.35■□□□□ 0.53
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